据中国知网(CNKI)2011年提供的"中国学术期刊影响因子年报（自然科学与工程技术.2011）"，《天然产物研究与开发》杂志影响因子为1.213，在117种中医学与中药学期刊影响因子排名中位居第5位，在90种生物学期刊影响因子排名中名列第21位。
