天然产物研究与开发 ›› 2018, Vol. 30 ›› Issue (6): 1066-1072.doi: 10.16333/j.1001-6880.2018.6.024
任聪1,于大永1,魏来2,张秀莉2,冯宝民1,史丽颖1*,曹洪玉1*
REN Cong1,YU Da-yong1,WEI Lai2,ZHANG Xiu-li2,FENG Bao-min1,SHI Li-ying1*,CAO Hong-yu1*
摘要: 本实验采用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)建立GPR35受体香豆素类激动活性的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型,以确定该类激动剂的分子结构与其生物活性之间的定量关系。在预测半数有效浓度(EC50)的CoMFA模型中,训练集抽一法(LOO)交叉验证系数q2=0.559,非交叉验证系数r2=0.887,标准偏差SE=0.382;在CoMSIA模型中,训练集抽一法交叉验证系数q2=0.627,非交叉验证系数r2=0.915,标准偏差SE=0.365。在预测半数抑制浓度(IC50)的CoMFA模型中,训练集抽一法交叉验证系数q2=0.600,非交叉验证系数r2=0.903,标准偏差SE=0.375;在CoMSIA模型中,训练集抽一法交叉验证系数q2=0.566,非交叉验证系数r2=0.914,标准偏差SE=0.378。EC50和IC50的两个3D-QSAR模型预测结果同实验数据基本一致,说明模型的预测能力较好。本实验根据模型预测结果,对配体分子的结构进行分析,为获得具有更高活性的配体分子提供理论依据。
中图分类号:
R914.2